Utilitas HerdPlus
HerdPlus: SeH untuk ukuran sampel tetap dan titik potong
Hitung sensitivitas kawanan (SeH) dan spesifisitas kawanan (SpH) untuk yang ditentukan
sensitivitas uji, spesifisitas uji, jumlah reaktor dan desain cut-point
prevalensi untuk daftar ukuran kelompok dan ukuran sampel yang sesuai.
Simulasi meta juga dijalankan, menggunakan SeH dan SpH yang dihitung untuk masing-masing
ukuran kawanan, untuk menghitung jumlah ternak yang diperlukan untuk diuji untuk mencapai a
sensitivitas sistem target yang ditentukan (SSe). SSe tercapai dan jumlah hewan menjadi
diuji dari sejumlah ternak yang dipilih secara acak dari populasi
juga dihitung.
Input termasuk:
- Uji sensitivitas dan spesifisitas;
- Nilai prevalensi desain tingkat hewan dan kelompok ternak;
- Jumlah reaktor cut-point yang diinginkan untuk menyatakan kawanan positif;
- Jumlah target kelompok yang akan diuji dari populasi;
- Sensitivitas sistem target (SSe) untuk skema pengujian populasi;
- Jumlah iterasi per simulasi dan jumlah simulasi untuk meta-simulasi pengujian populasi;
- Ketepatan hasil yang diinginkan (jumlah digit yang akan ditampilkan setelah titik desimal); dan
- Data yang ditempel terdiri dari kolom untuk ukuran kelompok dan ukuran sampel serta jumlah atau frekuensi relatif dari masing-masing ukuran kelompok dalam populasi. Sertakan baris judul kolom dalam data.
Catatan:Sejumlah besar meta-simulasi umumnya hanya memberikan minimal
manfaat tambahan dan dapat menyebabkan sistem crash jika digunakan dalam kombinasi dengan sejumlah besar iterasi. Maksimal 100 meta-simulasi biasanya cukup.
Hasil dihitung menggunakan metode HerdPlus (Greiner 2006?) Dan termasuk:
- Tabel nilai SeH dan SpH untuk setiap kelompok dan ukuran sampel yang ditentukan;
- Plot nilai SeH dan SpH terhadap ukuran kelompok;
- Tabel ringkasan hasil meta-simulasi termasuk median dan persentil ke-5/95 dari jumlah ternak yang diperlukan untuk mencapai SSe target dan SSe yang dicapai serta jumlah hewan yang diuji dalam skema yang dioptimalkan untuk skema jumlah ternak tertentu yang diuji; dan
- Hasil rinci meta-simulasi.
Pengakuan
Dikembangkan oleh Matthias Greiner dan Sersan Evan