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HerdPlus: SEH pour une taille d'échantillon et un point de coupure fixes

Sensibilité du test

Spécificité du test

Nombre de points de coupure des réacteurs

Valeur de prévalence prévue au niveau de l'animal

prévalence limite au niveau du troupeau

Nombre cible de troupeaux testés

Sensibilité du système cible pour une stratégie optimisée

Précision (chiffres significatifs)

Nombre de méta simulations

10 100 1000

Nombre d'itérations pour chaque méta-simulation

100 1000 10000

Télécharger un exemple de données

Soumettre

Calculer la sensibilité du troupeau (SeH) et la spécificité du troupeau (SpH) pour une sensibilité du test, spécificité du test, nombre de réacteurs et conception prévalence pour une liste des tailles de troupeau et des tailles d'échantillon correspondantes.

Une méta-simulation est également exécutée, en utilisant les valeurs SeH et SpH calculées pour chaque taille du troupeau, pour calculer le nombre de troupeaux à tester pour obtenir une sensibilité de système cible spécifiée (SSe). SSe atteint et le nombre d'animaux à être testés à partir d'un nombre spécifié de troupeaux sélectionnés au hasard dans la population sont également calculés.

Les entrées incluent:

• Sensibilité et spécificité du test;
• Valeurs de prévalence pour la conception au niveau de l'animal et du troupeau;
• Nombre limite de réacteurs souhaité pour déclarer un troupeau positif;
• Nombre cible de troupeaux à tester parmi la population;
• Sensibilité du système cible (SSe) pour le schéma de test de population;
• Nombre d'itérations par simulation et nombre de simulations pour la méta-simulation d'essais en population;
• La précision souhaitée des résultats (nombre de chiffres à afficher après le signe décimal); et
• Données collées comprenant des colonnes pour la taille du troupeau et la taille de l'échantillon et les dénombrements ou la fréquence relative de chaque troupeau dans la population. Inclure une ligne d'en-têtes de colonne dans les données.

Note:Un grand nombre de méta-simulations ne fournissent généralement qu'un minimum avantage supplémentaire et peut entraîner une panne du système s'il est utilisé en combinaison avec un grand nombre d'itérations. Un maximum de 100 méta-simulations est généralement suffisant.

Les résultats sont calculés selon la méthode HerdPlus (Greiner 2006?) Et incluent:

• Tableau des valeurs SeH et SpH pour chaque troupeau spécifié et taille d'échantillon;
• Parcelle des valeurs SeH et SpH en fonction de la taille du troupeau;
• ableau récapitulatif des résultats de méta-simulation comprenant les médianes et les 5ème / 95ème centiles du nombre de troupeaux requis pour atteindre le SSe cible et du SSe atteint et du nombre d'animaux testés selon le schéma optimisé pour le nombre spécifié de troupeaux testés; et
• Résultats détaillés des méta-simulations.

Remerciement

Développé par Matthias Greiner et Evan Sergeant